Microbiologie (Ch1Micro)

Objectifs :

Le cours aborde quatre thèmes :

1. Un aperçu de la grande diversité du monde microbien et des caractéristiques majeures de ses principales catégories.

2. Une approche de l'organisation et du fonctionnement des organismes procaryotes.

3. Les principes régissant l'interaction entre les micro-organismes et leurs hôtes ainsi que les stratégies anti-microbiens existantes. Un accent particulier est mis sur les effets de la flore microbienne sur l'humain, ses conséquences médicales et leurs prolongements en milieu hospitalier.

4. L'exploitation industrielle et scientifique du monde microbien.    

Compétences :

connaissances scientifiques et rigueur
Capacité de compréhension face à un problème

Prérequis :

Contenu du cours :

Le monde microbien et la microbiologie

1. Des micro-organismes à la microbiologie

2. Les frontières du monde microbien

3. Evolution du monde microbien

4. La frontière moléculaire eucaryote /procaryote

5. Les règnes microbiens

Les micro-organismes eucaryotes

1. Caractéristiques communes

2. Les algues - Caractéristiques les plus partagées - Classification

3. Les protozoaires - Caractéristiques les plus partagées - Classification

4. Les fungi - Caractéristiques les plus partagées - Croissance végétative - Reproduction - Classification - Les levures

Les micro-organismes procaryotes

1. Caractéristiques communes

2. Classification générale des bactéries

3. Les archéobactéries

Les virus

1. Caractéristiques communes

2. Constituants

3. Critères de classification

4. Cycle de l'infection virale

5. Intégration au sein du génome cellulaire

6. Les bactériophages tempérés

7. Les virus oncogènes

8. Culture et dénombrement des virus

Anatomie fonctionnelle des bactéries

1. Caractéristiques générales

2. Le cytoplasme bactérien

3. La membrane cytoplasmique

4. La paroi bactérienne

5. La capsule

6. La spore bactérienne

7. Les appendices externes

8. Le patrimoine génétique

9. Acquisition d'information génétique

La croissance bactérienne

1. La multiplication bactérienne

2. La croissance de la population

3. Mesure de la croissance d'une population

4. Paramètres physico-chimiques affectant la multiplication

Exigences nutritionnelles des bactéries

1. Source d'énergie

2. Les nutriments

3. Milieux de culture

4. Conservation des bactéries

Voies métaboliques des procaryotes

1. Voies métaboliques et énergétiques

2. L'ATP et le NAD

3. Les grandes étapes du métabolisme

4. Réoxydation du coenzyme

5. Bilan énergétique du catabolisme

6. La photosynthèse

Eléments de systématique bactérienne

1. Organisation du classement

2. Difficultés liées à la taxonomie bactérienne

3. Critères de classification

4. Eubactéries Gram +

5. Eubactéries Gram -

6. Au-delà des eubactéries communes

Les interactions micro-organismes / hôtes

1. Les associations symbiotiques

2. Les interactions micro-organismes / Humain

3. Le parasitisme - Stratégie de virulence

4. Les mécanismes physiologiques de défense

5. Stratégies de contournement des défenses de l'hôte

Les stratégies anti-microbiennes

1. Stérilisation, Désinfection, Antisepsie

2. Résistance à la désinfection

3. Méthodes physiques

4. Agents chimiques-Antiseptique et désinfectant-Les antibiotiques

5. Les stratégies vaccinales

L'exploitation du monde microbien

1. Fermentation et bioconversion

2. La fermentation industrielle

3. La bioconversion

4. Micro-organismes et activité industrielle

Méthode d'enseignement :

Exposés    

Lectures recommandées :

- PRESCOTT, HARLEY, KLEIN

Microbiologie, De Boeck Université, (2ème éd.), 2003

- BROCK

Biologie des micro-organismes, M. Madigan, J. Martinko, (11ème éd.), Pearson Education, 2007

Méthode d'évaluation :

Examen écrit